Na području Varaždinske biskupije djeluje nekoliko katoličkih udruga laika. One su samostalne u svome djelovanju, a njihov rad prati Ured za katoličke laičke udruge koji vodi preč. mr. Josip Koprek.

Katolički pokret Mali tečaj kršćanstva - Kursiljo zaživio je u župama Varaždinske biskupije u godini njezina osnutka, 1997. godine, i to s projektom župnih tečajeva. U prvih 10 godina postojanja biskupije, Kursiljo je održan 20 puta u 10 župa. 2006. g. ravnateljem i duhovnikom Kursilja u Varaždinskoj biskupiji imenovan je vlč. Stjepan Najman. U listopadu 2007. g. varaždinski biskup mons. Josip Mrzljak potpisao je zajedno s ravnateljem Kursilja vlč. Najmanom i rektorom laikom Elizabetom Haček Statut Kursilja.

Podružnica Hrvatskog katoličkog liječničkog društva u Varaždinu osnovana je 1998. godine kao sastavni dio HKLD-a, osnovanog 1991. godine u Zagrebu. Riječ je o laičkoj strukovnoj organizaciji u sklopu Katoličke Crkve koja okuplja liječnike i nemedicinske djelatnike koji rade u zdravstvu i skrbe za bolesnike. Cilj udruge je podrška zdravstvenim djelatnicima pri promicanju kršćanskih načela u radu, te pri nastojanju da se ljudski život sačuva od začeća do prirodne smrti. Nekoliko godina varaždinska podružnica okupljala je članove s područja cijele Biskupije. Godine 2003. osnovana je podružnica u Čakovcu, a 2005. HKLD je dobio svoju petnaestu podružnicu sa sjedištem u Koprivnici, treću na prostoru Varaždinske biskupije, koja obuhvaća i područje Đurđevca i Ludbrega.

Hrvatsko katoličko društvo prosvjetnih djelatnika u Zagrebu je osnovano 1993. godine s ciljem da okuplja djelatnike u izobrazbi i odgoju radi izmjene iskustava, duhovnog i strukovnog napretka članova i zajedničkog djelovanja. Nakon što je dvije godine u Varaždinu djelovao Ogranak zagrebačkog HKDPD-a, 2003. godine varaždinski Ogranak postaje samostalno društvo.
Duhovni asistent HKDPD Varaždin i HKLD Varaždin je preč. mr. Josip Koprek.

Hrvatska zajednica bračnih susreta (HZBS) jedna je od najstarijih zajednica u Europi. Od 1976. godine bračni susreti, tzv. Vikendi, održavaju se i u Hrvatskoj te je na njima sudjelovalo više stotina bračnih parova te desetak svećenika s područja Biskupije. Na čelu HZBS je nacionalni tim koji se sastoji od zajednice izabranog bračnog para voditelja i svećenika, a Regionalni tim u sličnom sastavu vodi članove zajednice iz pojedine regije. Hrvatska zajednica bračnih susreta na području Varaždinske biskupije (Regija Sjeverna Hrvatska) sastoji se od zajednica iz Čakovca, Virja, Pitomače, Koprivnice, Ivanca i Varaždina.

Katolička kolpinška udruga biskupije osnovana je u Varaždinu 1998. godine. Od osnutka predsjednik je Udruge prof. Zvonimir Čavlek, a duhovni je savjetnik kancelar mons. Antun Perčić. Društvo je organizirano po teritorijalnom načelu u ograncima koji se zovu "Kolpinška obitelj". Trenutno postoje tri Kolpinške obitelji, i to u varaždinskoj župi sv. Fabijana i Sebastijana, Knegincu i Murskom Središću, a još je njih nekoliko u osnivanju. Kolpinška udruga ili Kolpingovo djelo dio je svjetskog pokreta "KOLPINGWERK" kojeg je 1849. godine u Kölnu utemeljio njemački svećenik i socijalni reformator, bl. Adolf Kolping.